Protein–RNA interactions for Protein: Q14B02

Rnf133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf133Q14B02 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf133Q14B02 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf133Q14B02 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms