Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bop1P97452 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bop1P97452 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bop1P97452 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bop1P97452 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bop1P97452 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms