Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl9P51670 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms