Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epb41P48193 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms