Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Kif3aP28741 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms