Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms