Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trappc8E9PWG2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms