Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt71Q9R0H5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt71Q9R0H5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms