Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp2c55Q9D816 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp2c55Q9D816 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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