Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms