Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lactb2Q99KR3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lactb2Q99KR3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms