Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk4Q8VEJ3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk4Q8VEJ3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms