Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms