Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn6Q03958 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn6Q03958 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn6Q03958 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfdn6Q03958 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfdn6Q03958 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfdn6Q03958 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfdn6Q03958 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfdn6Q03958 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfdn6Q03958 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfdn6Q03958 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms