Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme1P97371 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psme1P97371 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme1P97371 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms