Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RptnP97347 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RptnP97347 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RptnP97347 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RptnP97347 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RptnP97347 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RptnP97347 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RptnP97347 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RptnP97347 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RptnP97347 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RptnP97347 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RptnP97347 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RptnP97347 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RptnP97347 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RptnP97347 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RptnP97347 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RptnP97347 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RptnP97347 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RptnP97347 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RptnP97347 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RptnP97347 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RptnP97347 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RptnP97347 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RptnP97347 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RptnP97347 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RptnP97347 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RptnP97347 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RptnP97347 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RptnP97347 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RptnP97347 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RptnP97347 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RptnP97347 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RptnP97347 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms