Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2mP61082 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2mP61082 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms