Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CratP47934 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CratP47934 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CratP47934 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CratP47934 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CratP47934 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CratP47934 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CratP47934 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CratP47934 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CratP47934 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CratP47934 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CratP47934 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CratP47934 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CratP47934 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CratP47934 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CratP47934 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CratP47934 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CratP47934 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CratP47934 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CratP47934 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms