Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prf1P10820 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prf1P10820 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prf1P10820 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prf1P10820 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms