Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabep1O35551 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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