Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smad7O35253 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad7O35253 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad7O35253 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad7O35253 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad7O35253 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad7O35253 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad7O35253 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad7O35253 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad7O35253 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad7O35253 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad7O35253 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad7O35253 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad7O35253 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad7O35253 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad7O35253 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad7O35253 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad7O35253 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad7O35253 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad7O35253 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad7O35253 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad7O35253 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad7O35253 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad7O35253 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad7O35253 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad7O35253 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad7O35253 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad7O35253 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad7O35253 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms