Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trappc8E9PWG2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trappc8E9PWG2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms