Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpv2Q9WTR1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.5 ms