Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms