Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Cldn19Q9ET38 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Cldn19Q9ET38 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Cldn19Q9ET38 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Cldn19Q9ET38 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn19Q9ET38 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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