Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtpbp4Q99ME9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp4Q99ME9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms