Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtn4rl2Q7M6Z0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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