Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zbtb40Q6PCS8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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