Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NipblQ6KCD5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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