Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Knl1Q66JQ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knl1Q66JQ7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knl1Q66JQ7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knl1Q66JQ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knl1Q66JQ7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knl1Q66JQ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knl1Q66JQ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knl1Q66JQ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knl1Q66JQ7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knl1Q66JQ7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms