Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mdc1Q5PSV9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdc1Q5PSV9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms