Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TchpQ3TVW5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms