Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bop1P97452 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms