Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa10P31310 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms