Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnga1P29974 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga1P29974 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms