Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Psmb10O35955 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb10O35955 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb10O35955 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Psmb10O35955 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Psmb10O35955 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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