Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbip1J3QMK2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms