Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rfx7F8VPJ6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx7F8VPJ6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms