Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms