Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM2

1700003H04Rik, RIKEN cDNA 1700003H04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003H04RikE9PXM2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700003H04RikE9PXM2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700003H04RikE9PXM2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms