Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trappc8E9PWG2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc8E9PWG2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms