Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ankrd60A2AMD2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ankrd60A2AMD2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms