Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col9a3A2ACT7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a3A2ACT7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms