Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Knop1Q9Z2Q2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Knop1Q9Z2Q2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms