Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Arpc1bQ9WV32 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms