Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn19Q9ET38 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn19Q9ET38 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms