Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spns3Q9D232 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spns3Q9D232 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spns3Q9D232 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spns3Q9D232 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spns3Q9D232 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spns3Q9D232 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spns3Q9D232 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spns3Q9D232 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Spns3Q9D232 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spns3Q9D232 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms