Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx15Q91WE1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms