Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
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Card11Q8CIS0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Card11Q8CIS0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Card11Q8CIS0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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