Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtn4rl2Q7M6Z0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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